L’Indonésie est un pays transcontinental d'Asie du Sud-Est et d'Océanie. Avec plus de 17 500 îles, il s'agit du plus grand archipel au monde.
Il a été touché par l’influenza aviaire hautement pathogène (IAHP) plus que n’importe quel autre pays dans le monde. Depuis 2003, quand l’infection a été détectée dans Java central, elle s’est étendue à 31 des 33 provinces causant ainsi jusqu’à 500 millions de dollars de pertes économiques.
Ce pays a reçu le plus grand soutien de la communauté internationale pour combattre l’IAHP, le Ministère de l’Agriculture Indonésien travaillant principalement en association avec la FAO. Ils se sont ainsi concentrés sur le développement d’une surveillance extensive de la maladie, sur des programmes de vaccination et d’abattage.
Il faut savoir que la taille et la géographie de ce pays vont à l’encontre de réponses efficaces en matière de santé animale et que la maladie est actuellement considérée comme endémique en Indonésie.
A Java, 100 millions de personnes vivent proches de très grandes populations d’oiseaux. Au total l’Indonésie produit environ un milliard de poulets de chairs par an, d’où l’importance de mettre en place des réseaux de surveillance actifs. L’aviculture et les activités qui y sont associées représentent 1% du PIB.
On répertorie toujours de nombreux foyers de l’IAHP H5N1 au niveau de cet archipel, même si la prévalence du virus varie entre les différents villages. En effet seulement deux des 33 provinces n’ont jamais reporté de cas d’IAHP H5N1.
Avant la déclaration d’endémicité du pays, l’OIE a recensé 261 foyers de la maladie. L’Indonésie a déclaré 163 cas humains de H5N1 hautement pathogène depuis le début de l’épizootie en 2003, 135 cas ont été mortels (Avril 2010).